ソニーペイメントサービス（WelcartPay）は一つ申し込みすれば、何個ネットショップを作成しても利用できるのでしょうか？

基本的に、ソニーペイメントサービスとのご契約は1サイトに1契約が必要となります。
1サイトとはWordPressとWelcartのセットが一つという事になります。