single_item.php はテーマテンプレートではなくプログラムの一部となります。ある程度のphpプログラミングのスキルがなければカスタマイズは危険かと思います。またこのフォーラムでは時間の関係上PHPの基礎的な内容の解説はできません。何卒ご理解ください。
$this->itemsku はSKU表示名が格納された変数です。
esc_html() はWordPress の関数でメタ処理を行っています。
単一SKUが書かれたコードの削除とは、条件分岐用のコードも含めて全てを削除しなくてはいけません。ページが表示されなくなったのは単にエラーのためかと思います。
ショップのシステムはリスクの高いものです。本体のカスタマイズはシステム自体を良くご理解いただいてから行うようにしてください。ご自分で難しい場合は業者にご依頼されるのが安全かと思います。