2)の件につきまして、試行錯誤の末以下のように記述することで希望通りの表示ができました。
<?php $imageid = usces_get_itemSubImageNums(); ?>
<?php foreach ( $imageid as $id ) : ?>
<?php if( $id === 1 ) : ?>
<?php else : ?>
<li><a>" <?php echo apply_filters('usces_itemimg_anchor_rel', NULL); ?>><?php usces_the_itemImage($id, 80, 80, $post); ?></a></li><?php endif; ?>
<?php endforeach; ?>
ifの後に何も入れていないのですが、これで問題ないでしょうか。