いくつかのカテゴリーがsingle.phpをよんでしまう

[natsworks]

お世話になっております。

https://sitename.com/category/item/brands/brand-name/
というカテゴリ構造のURLを
https://sitename.com/brand-name/
と調整する為、functions.phpに以下を明記してURLをリライトしております。

    add_filter('user_trailingslashit', 'remcat_item');
    function remcat_item($link) {
        return str_replace("category/item/", "/", $link);
    }

    add_filter('user_trailingslashit', 'remcat_brand');
    function remcat_brand($link) {
        return str_replace("brands/", "/", $link);
    }

    add_action('init', 'remcat_flush_rules');
    function remcat_flush_rules() {
        global $wp_rewrite;
        $wp_rewrite->flush_rules();
    }
    add_filter('generate_rewrite_rules', 'remcat_rewrite');
    function remcat_rewrite($wp_rewrite) {
        $new_rules = array('(.+)/page/(.+)/?' => 'index.php?category_name='.$wp_rewrite->preg_index(1).'&paged='.$wp_rewrite->preg_index(2));
        $wp_rewrite->rules = $new_rules + $wp_rewrite->rules;
    }

こちらによって、意図したURLにて表示する事ができ、ペイジャーも動くような構造が実現できたかと思われたのですが、カテゴリーによってcategory.phpをよんでいる場合と、single.phpをよんでいるものがあり、こうなってしまう原因が分かりません。カテゴリを追加したり並び替えをしている間に、上記コードを挿入したり作業していたので、どの作業更新タイミングでなってしまったのか分かりませんが、改善策はありますでしょうか？

https://sitename.com/brand-AAA/ (single.php)
https://sitename.com/brand-BBB/ (category.php)
というような状態が「投稿/カテゴリ」の中でおきている。

現状のコードがfunctions.phpに設置されている状態にて、新規で追加したカテゴリについてはcategory.phpをよんでおり正常に動作します。

すてにsingle.phpをよんでしまっているカテゴリについては、一度削除して再度作成しても、single.phpをまたよんでしまいます。クイック編集でbrand-AAAをbrand-AAA2とするだけで改善されます。

確定で必須のslug名となり、別の名称では作れないので何とか改善したいのですが、何か方法ありますでしょうか？

よろしくお願いいたします。

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