runta 様
この度はお手数をおかけいたしました。
Development Version は、将来正式にリリースされる開発バージョンですので、今回の修正が消えることはありません。
> 本リリースの自動アップグレードでも削除されます
というのは、Welcart 本体のソースファイルをご自身で改変されている場合、Development Version に限らず、Welcart をアップデートする度に改変箇所は上書きされます、という意味になります。
また、恐れ入りますが WCEX Multiple Shipping のバージョンを教えていただけますでしょうか。